Neustále sa meniace prostredie vedie k vyhynutiu zvierat, ktoré nie sú schopné prežiť v zmenenom prostredí, a podporuje prežitie tých najschopnejších, ktoré vyvrcholí evolúciou nového druhu. Avšak tylacín (bežne známy ako tasmánsky tiger alebo tasmánsky vlk), vačkovitý mäsožravý cicavec pochádzajúci z Austrálie, ktorý vyhynul asi pred storočím, nie v dôsledku prirodzeného procesu organický evolúcie, ale v dôsledku ľudského vplyvu môže vyhynúť a znovu žiť asi o desaťročie. Posledný žijúci tylacín zomrel v roku 1936, ale našťastie sa v múzeách našlo vhodne zachovaných veľa embryí a mladých jedincov. Genóm tylacínu už bol úspešne sekvenovaný pomocou tylacínovej DNA extrahovanej zo 108-ročnej vzorky zachovanej vo Victoria Museum v Austrálii. Výskumný tím sa nedávno spojil s biotechnologickou firmou, aby urýchlil úsilie o vzkriesenie.
Laboratórium integrovaného výskumu genomickej obnovy (TIGRR) Univerzity v Melbourne spolupracovalo s Kolosálne biologické vedy, spoločnosť zaoberajúca sa genetickým inžinierstvom na urýchlenie úsilia o vzkriesenie tasmánskeho tigra (Thylacinus cynocephalus). V rámci dohody sa laboratórium TIGRR univerzity zameria na zavedenie reprodukčných technológií prispôsobených austrálskym vačkovcom, ako je IVF a tehotenstvo bez náhrady, zatiaľ čo Kolosálne biologické vedy poskytne svoje zdroje na úpravu génov CRISPR a zdroje výpočtovej biológie na reprodukciu tylacínovej DNA.
Tylacín (Thylacinus cynocephalus) je vyhynutý mäsožravý vačnatý cicavec, ktorý pochádza z Austrálie. Bol známy ako tasmánsky tiger vďaka svojej vyzlečenej spodnej časti chrbta. Mal psí vzhľad, a preto bol známy aj ako tasmánsky vlk.
Z austrálskej pevniny zmizol asi pred 3000 rokmi v dôsledku lovu ľuďmi a konkurencie s dingami, ale populácii sa darilo na ostrove Tasmánia. Ich počet v Tasmánii začal klesať s príchodom európskych osadníkov, ktorí ich systematicky prenasledovali pre podozrenie zo zabíjania dobytka. V dôsledku toho tylacín vyhynul. Posledný tylacín zomrel v zajatí v roku 1936.
Na rozdiel od mnohých vyhynutých zvierat, ako sú dinosaury, tylacín nevyhynul v dôsledku prirodzeného procesu organický evolúcia a prirodzený výber. Ich vyhynutie bolo spôsobené človekom, priamym dôsledkom lovu a zabíjania ľudí v nedávnej minulosti. Tylacín bol vrcholovým predátorom v miestnom potravinovom reťazci, teda zodpovedný za stabilizáciu ekosystému. Tiež tasmánsky biotop je relatívne nezmenený, pretože tylacín vyhynul, takže po opätovnom vysadení môžu ľahko znovu obsadiť svoje miesto. Všetky tieto faktory robia z tylacínu vhodného kandidáta na zánik alebo vzkriesenie.
Sekvenovanie genómu je prvým a mimoriadne kľúčovým krokom v úsilí o vyhubenie. Posledný tylacín zomrel v roku 1936, no našlo sa veľa embryí a mladých jedincov, ktoré sa zachovali vo vhodných médiách v múzeách. TIGRR Lab dokázalo extrahovať DNA tylacínu zo 108-ročného exemplára zachovaného vo Victoria Museum v Austrálii. Pomocou tejto extrahovanej DNA bol genóm tylacínu sekvenovaný v roku 2018 a aktualizovaný v roku 2022.
Sekvenovanie tylacínu genóm nasleduje sekvenovanie genómu dunnart a identifikácie rozdielov. Dunnart je blízky genetický príbuzný tylacínu patriaci do čeľade dasyuridae, do ktorého bude prenesené jadro vajíčka z bunky podobnej tylacínu.
Ďalším krokom je vytvorenie bunky podobnej tylacínu. S pomocou CRISPR a ďalších technológií genetického inžinierstva budú gény tylacínu vložené do genómu Dasyurid. Potom bude nasledovať prenos jadra bunky podobnej tylacínu do enukleovaného vajíčka Dasyurid pomocou somatickej bunky jadrový transfer (SCNT) technológie. Vajíčko s preneseným jadrom bude pôsobiť ako zygota a vyrastie na embryo. Embryonálny rast je podporovaný in vitro, kým nie je pripravený na prenos do náhrady. Vyvinuté embryo sa potom implantuje do náhradného embrya, po ktorom nasledujú štandardné kroky gestácie, dozrievania a pôrodu.
Napriek pozoruhodnému pokroku v genetickom inžinierstve a reprodukčných technológiách je vzkriesenie vyhynutého zvieraťa stále takmer nemožným problémom. Veľa vecí je v prospech projektu zániku tylacínu; snáď najdôležitejším faktorom je úspešná extrakcia tylacínovej DNA zo zachovaného múzejného exemplára. Odpočinok je technológia. V prípade zvierat, ako sú dinosaury, je vyhubenie nemožné jednoducho, pretože neexistuje spôsob, ako extrahovať užitočnú dinosauriu DNA na sekvenovanie genómu dinosaura.
***
Zdroje:
- University of Melbourne 2022. Správy – Laboratórium urobilo „obrovský skok“ smerom k zániku tylacínu s kolosálnym technologickým partnerstvom v oblasti genetického inžinierstva. Uverejnené 16. augusta 2022. Dostupné na https://www.unimelb.edu.au/newsroom/news/2022/august/lab-takes-giant-leap-toward-thylacine-de-extinction-with-colossal-genetic-engineering-technology-partnership2
- Laboratórium integrovaného výskumu genómovej obnovy tylacínu (TIGRR Lab) https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/the-thylacine/ & https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/research/
- tylacín https://colossal.com/thylacine/
***
, a marsupial carnivore mammal indigenous to Australia that became extinct about a century ago, not due to natural process of organic evolution, but due to human influence may become de-extinct and live again in about a decade time. Last living thylacine died in 1936 but luckily, many embryos and young specimens were found suitably preserved in the museums. Thylacine genome has already been successfully sequenced using thylacine DNA extracted from 108-year-old specimen preserved at the Victoria Museum in Australia. The research team has recently tied up with a biotech firm to accelerate the efforts of resurrection.){kind=link}