Prípady koinfekcií s dvoma variantmi boli hlásené skôr. O vírusovej rekombinácii poskytujúcej vírusy s hybridnými genómami sa veľa nevedelo. Dve nedávne štúdie uvádzajú prípady genetickej rekombinácie medzi variantmi SARS-CoV-2 Denta & Omicron. Rekombinant, nazývaný Deltamicron, mal vlastnosti oboch variantov.
Termín „Deltakron“ sa objavil začiatkom tohto roka1 na označenie prípadov koinfekcie ľudí COVID-19 rôznymi variantmi variantov SARS-Cov-2, napr. delta a omikrón. Delmicron alebo Deltacron odkazovali na infekciu spôsobenú kombináciou „dvoch variantov rovnakého kmeňa vírusu SARS CoV-2“ a nehovorilo sa, že by boli odlišné“kmene".
Avšak prípady genetickej rekombinácie medzi dvoma rôznymi kmeňmi SARS-2 boli nedávno hlásené. Dňa 08. marca 2022 výskumníci2 hlásili tri infekcie v južnom Francúzsku s „Deltamicron“ rekombinantným s hybridom genóm ktorý mal hrotový proteín z variantu Omicron a „telo“ variantu Delta. Hybrid genóm mali podpisové mutácie dvoch línií. Rekombinantný hrot by mohol optimalizovať väzbu vírusu na membránu hostiteľskej bunky.
Dôkazy pre Deltu a Omicron rekombinácia sa objavila z USA3 tiež. Tento tím mohol identifikovať dva nezávislé prípady rekombinantného Delta-Omicron. V oboch prípadoch ide o 5′-koniec vírusu genóm bol z delty genóma 3′-end od Omicron.
Predpokladá sa, že rekombinantné vírusy nie sú bežné a neexistuje žiadny dôkaz, ktorý by naznačoval, že rekombinantné vírusy s hybridným genómy sú prenosnejšie alebo virulentnejšie ako dominantné cirkulujúce varianty.
***
Referencie:
- Deltacron nie je nový kmeň alebo variant. Vedecký Európan. Uverejnené 9. januára 2022. Dostupné na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/
- Colson, P., et al 2022. Kultúra a identifikácia „Deltamicron“ SARS-CoV-2 v troch prípadoch klastra v južnom Francúzsku. Predtlač medRxiv. Uverejnené 08. marca 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812
- Bolze A., et al 2022. Dôkazy o koinfekciách a rekombináciách SARS-CoV-2 Delta a Omicron. Predtlač medRxiv. Uverejnené 12. marca 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113
***
